Durante a Segunda Guerra Mundial, em abril de 1944, convocaram Afonso Pereira para servir no exército depois de ele concluir o curso de especialização em armas e Infantaria. Ele integrou a 1ª turma de concluintes, conhecida como Vidal de Negreiros, do Núcleo de Preparação de Oficiais de Reserva do 15º Batalhão de Infantaria Motorizada. Graças à sua sólida formação e habilidade na língua alemã, ele alcançou rapidamente a patente de oficial. Em 15 de outubro de 1947, promoveram-no ao posto de segundo tenente da reserva de segunda classe.

“A espada que recebemos tem seu significado sagrado, ela simboliza a espada da justiça que há de cortar o elo de toda a violência que é o desespero e a agonia da força. Pois esta não resiste a uma descontinuidade a um golpe da razão e do direito…” 

Trecho extraído do discurso proferido na solenidade de despedida do 15º Regimento de Infantaria da turma de aspirantes a oficial da reserva do exército.

João Pessoa, 21 de abril de 1944.